Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brd3Q8K2F0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms