Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrit1Q8K099 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrit1Q8K099 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrit1Q8K099 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrit1Q8K099 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrit1Q8K099 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrit1Q8K099 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrit1Q8K099 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrit1Q8K099 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrit1Q8K099 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms