Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp2Q8CGR7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp2Q8CGR7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms