Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc3Q8CFZ4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms