Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Setd1bQ8CFT2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Setd1bQ8CFT2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Setd1bQ8CFT2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Setd1bQ8CFT2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.1 ms