Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2bQ8CFI7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2bQ8CFI7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms