Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl1Q8CEQ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms