Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx30Q8CE50 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx30Q8CE50 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx30Q8CE50 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms