Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc17Q8CE13 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms