Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RybpQ8CCI5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms