Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb1Q8CBF3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb1Q8CBF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms