Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc5Q8CAL5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms