Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc113Q8C5T8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc113Q8C5T8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms