Protein–RNA interactions for Protein: Q8C159

Ttc22, Tetratricopeptide repeat protein 22, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc22Q8C159 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc22Q8C159 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc22Q8C159 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms