Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skor1Q8BX46 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skor1Q8BX46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skor1Q8BX46 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skor1Q8BX46 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms