Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx1bQ8BX32 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx1bQ8BX32 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx1bQ8BX32 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slx1bQ8BX32 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms