Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctdsp2Q8BX07 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp2Q8BX07 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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