Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms