Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp38Q8BW70 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp38Q8BW70 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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