Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUV3

Gphn, Gephyrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GphnQ8BUV3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
GphnQ8BUV3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GphnQ8BUV3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GphnQ8BUV3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GphnQ8BUV3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GphnQ8BUV3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GphnQ8BUV3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GphnQ8BUV3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GphnQ8BUV3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GphnQ8BUV3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GphnQ8BUV3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms