Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia2Q8BSS9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia2Q8BSS9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms