Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pbrm1Q8BSQ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pbrm1Q8BSQ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pbrm1Q8BSQ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms