Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bicd1Q8BR07 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bicd1Q8BR07 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bicd1Q8BR07 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.4 ms