Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rab3gap2Q8BMG7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab3gap2Q8BMG7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms