Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smoc1Q8BLY1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smoc1Q8BLY1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms