Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Usp54Q8BL06 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Usp54Q8BL06 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Usp54Q8BL06 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Usp54Q8BL06 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Usp54Q8BL06 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Usp54Q8BL06 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Usp54Q8BL06 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Usp54Q8BL06 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Usp54Q8BL06 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Usp54Q8BL06 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Usp54Q8BL06 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp54Q8BL06 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms