Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tspan12Q8BKT6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan12Q8BKT6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan12Q8BKT6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms