Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prune1Q8BIW1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prune1Q8BIW1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prune1Q8BIW1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms