Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc40Q8BI79 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc40Q8BI79 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms