Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK1

Nipa1, Magnesium transporter NIPA1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipa1Q8BHK1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nipa1Q8BHK1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nipa1Q8BHK1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nipa1Q8BHK1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nipa1Q8BHK1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nipa1Q8BHK1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nipa1Q8BHK1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Nipa1Q8BHK1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nipa1Q8BHK1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nipa1Q8BHK1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipa1Q8BHK1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nipa1Q8BHK1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms