Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubash3bQ8BGG7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubash3bQ8BGG7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms