Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim6Q8BGE7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim6Q8BGE7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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