Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htatsf1Q8BGC0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Htatsf1Q8BGC0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms