Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pknox2Q8BG99 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pknox2Q8BG99 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms