Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc17a8Q8BFU8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc17a8Q8BFU8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc17a8Q8BFU8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc17a8Q8BFU8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms