Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfascQ810U3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NfascQ810U3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms