Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc172Q810N9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc172Q810N9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms