Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim19Q80ZU4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim19Q80ZU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms