Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crb2Q80YA8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crb2Q80YA8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crb2Q80YA8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crb2Q80YA8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crb2Q80YA8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb2Q80YA8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb2Q80YA8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms