Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcsk9Q80W65 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk9Q80W65 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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