Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnQ80U62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RubcnQ80U62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms