Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cep170bQ80U49 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cep170bQ80U49 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cep170bQ80U49 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cep170bQ80U49 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cep170bQ80U49 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms