Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ppp6r1Q7TSI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp6r1Q7TSI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp6r1Q7TSI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms