Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccp110Q7TSH4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccp110Q7TSH4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms