Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN73

Casd1, N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casd1Q7TN73 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casd1Q7TN73 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casd1Q7TN73 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 403 ms