Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HhipQ7TN16 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms