Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp17leQ7M764 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp17leQ7M764 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17leQ7M764 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17leQ7M764 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17leQ7M764 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17leQ7M764 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17leQ7M764 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17leQ7M764 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17leQ7M764 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17leQ7M764 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17leQ7M764 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17leQ7M764 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms