Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6dQ76KF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sema6dQ76KF0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6dQ76KF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms