Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv1Q704Y3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv1Q704Y3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trpv1Q704Y3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms