Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup188Q6ZQH8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup188Q6ZQH8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms